Система мононуклеарных фагоцитов (СМФ) считается одним из центров регуляции местного иммунного ответа. Она принимает участие в большинстве физиологических и патологических процессов, а именно - местном гомеостазе, регуляции трофики и иммунологических реакций как первичного, так и вторичного иммунного ответа. Основной клеточной популяцией СФМ является макрофаг, который является стационарной клеткой, способной передвигаться лишь в пределах тканевого пласта. Под непосредственным контролем макрофагов находятся дендритные клетки, также являющиеся представителями СМФ. В слизистой оболочке кишечника сосредоточено до 80% всех иммунокомпетентных клеток. Для адекватного взаимодействия с кишечной микробиотой и обеспечения иммунологической толерантности к нормальным комменсалам имеется лимфоидная ткань, ассоциированная со слизистой оболочкой кишечника (gut-associated lymphoid tissue – GALT), в составе которой мононуклеарные фагоциты реализуют свои наиболее значимые функции. При проникновении в слизистую оболочку патогенных микроорганизмов сеть резидентных макрофагов как иммунный барьер запускает воспалительную реакцию для последующей стабилизации гомеостаза. Однако, выраженная микробная и антигенная нагрузка в кишке требует обязательного присутствия клеток специфического иммунитета – лимфоцитов, незрелые формы которых располагаются в структурах GALT и специализируются под руководством мононуклеарных фагоцитов. После окончательной дифференцировки лимфоциты, экспрессируя интегрин α4β7, способны из системного кровотока вновь вернуться в слизистую оболочку кишечника для выполнения высокоспецифичных функций. Данный феномен именуется хоуминг-эффектом. Отмечено, что при неспецифическом язвенном колите и болезни Крона увеличивается как количество регуляторных Т-лимфоцитов, так и экспрессия ими интегрина α4β7. Патология хоуминг-эффекта, по мнению некоторых исследователей, объясняет возможность отдаленных вторичных поражений при хронических воспалительных заболеваниях кишечника с развитием системной патологии.